Коруктун фаунасы 6 отряд, жырткыч сүт эмүүчүлөрдүн 12 түрү менен берилген. Коруктун аймагында сүт эмүүчүлөрдүн 46 түрү жашайт, анын ичинде төмөнкү негизги жана индикатор түрлөрү: жапайы каман, эчки, кумдук коён, түлкү, карышкыр, Тянь-Шань аюу, Түркстан сүлөөсүн, илбирс, таш суур, америкалык норка, Орто Азия суусары, эрмин, келтек, кирпи жана суур Мензбиер. Коруктун фаунасында өзгөчө орунду ээлейт. Батыш Тянь-Шандын эндемикалык жаныбары — Мензбир сууру. Ар кандай маалыматтар боюнча коруктун аймагында канаттуулардын 98ден 150гө чейин түрү жашайт. Герпетофауна негизинен төмөнкү бийиктик зонасында жашайт жана сойлоп жүрүүчүлөрдүн жана жерде-сууда жашоочулардын 10 түрүнөн турат, анын ичинде талаа агамасы, чөл өңдүү, Алай өңдүү, көп түстүү шарп, Никольский шарп ылаңы (же кыргыздын шарп ылаңы), боз геккон, сары курсак, суу жылан, оймо-чийме жылан, палла тумшугу. Коруктун ихтиофаунасына 12 түр кирет, анын ичинде төмөнкү түрлөр: кадимки маринка, жылаңач осман, «Сырдария» чаары, Түркстан сому, Талас бийи, Түркстан гуджаны, кабырчыктуу осман, Кушакевичский чар, Терек чар, чыгыш гамбусия, акклиматизант.